المرشح الذي نكشف عنه في هذا الاستعراض يمثل رائدةً بيولوجياً محتملة مدعومة بأدلة بنيوية وجينومية، لكنه لا يزال يتطلب التحقق في المختبر الرطب. ما يجعل هذا ذا معنى هو كيف أنه يخفض بشكل كبير حاجز الدخول إلى سير العمل البيولوجي اليومي، محولاً أياماً من الفرز المجزأ في قواعد البيانات إلى جلسة تعاونية واحدة. وبينما ركزت هذه الجلسة على نافذة ضيقة من الأحماض الأمينية في Streptococcus pseudopneumoniae، يمكن للباحثين توجيه المحادثة في أي اتجاه، مثل إضافة معايير تصفية جديدة، أو استكشاف أطوال تسلسل مختلفة، أو استهداف مسببات أمراض أولوية أخرى. ومن خلال توسيع نطاق البحث من المتكائكات البشرية إلى الميكروبات البيئية وما بعدها، يمكن للعلماء توجيه الوكيل عبر UniProt لاكتشاف مرشحين جدد للببتيدات المضادة للميكروبات (AMP) على نطاق واسع.
لوحة 3D مشتركة للتعاون التفاعلي
البنية ثلاثية الأبعاد (3D) للبروتين يمكن أن تساعدنا في فهم وظيفته البيولوجية. إن فحص الطية المتوقعة للمرشح في الفضاء أمر أساسي. ولتوفير سير عمل متكامل من البداية إلى النهاية في مساحة عمل واحدة، نقدم عارض البنية الجزيئية الحيوية، وهي أداة تصور 3D مدمجة مباشرة في Antigravity.
يعمل الباحث والوكيل معاً عبر حالة بصرية مشتركة. عندما يستعيد الوكيل البنى من قاعدة بيانات AlphaFold أو تنبؤات العالم الخاصة، يمكنه التحكم في العارض بشكل ديناميكي. فعلى سبيل المثال، يمكنه إبراز المناطق الوظيفية الرئيسية لشرح فرضياته بصرياً. والأهم من ذلك أن هذا الوعي يتدفق في الاتجاهين: حيث تتم مزامنة إجراءات مثل إبراز بقايا محددة أو تثبيت ملاحظات مباشرة على جيب ارتباط مع الوكيل. يمكن للباحث ببساطة أن يحدد منطقة اهتمام في الفضاء ثلاثي الأبعاد (3D) ويسأل، على سبيل المثال، "كيف قد يؤثر هذا الشريط β على ارتباط Lipid II؟"، مما يسمح للوكيل بالتفكير فوراً في السياق البنيوي الدقيق الذي ينظر إليه العالم.