نظام ذكاء اصطناعي توليدي باسم RFdiffusion3 قادر على تصميم البروتينات والأحماض النووية انطلاقاً من الذرات المنفردة، وقد كُشف رسمياً مؤخراً عن مخططه التصميمي الكامل. والأكثر إثارة أن البروتينات المصممة به حديثاً حققت بالفعل الوظائف المتوقعة في تفاعلات كيميائية حقيقية.
بني هذا النظام على يد فريق دولي يضم جامعة واشنطن الأمريكية وجامعة أكسفورد البريطانية وإنفيديا وغيرها من المؤسسات، وهو قادر على نمذجة الذرات المنفردة ومخصص لتصميم البروتينات والأحماض النووية، ونُشرت النتائج ذات الصلة في المجلة الدولية «ساينس» يوم 16 بالتوقيت المحلي. ويُلاحظ أن الفريق كان قد أتاح RFdiffusion3 كمصدر مفتوح في 3 ديسمبر 2025، أما هذه الورقة البحثية فتشرح مبادئ التصميم بتفصيل وافٍ.
الحائز على نوبل يقود البحث، وسرعة تفوق الجيل السابق بعشرة أضعاف
الكاتب المراسل لهذه الدراسة هو البروفيسور ديفيد بيكر من جامعة واشنطن، الذي حاز جائزة نوبل في الكيمياء لعام 2024 لاستخدامه الحاسوب في التنبؤ ببنية البروتينات، ومن أبرز إنجازاته نظام التنبؤ ببنية البروتينات RosettaFold. وقد نشأ كلاً من RFdiffusion1 (2023) وRFdiffusion2 (2025) بالاعتماد على شبكة التنبؤ بالبنية في RosettaFold؛ بينما يستند RFdiffusion3 إلى بنية شبكة AlphaFold3، ويصور الأحماض الأمينية المنفردة بحد أقصى 14 ذرة، ويبتكر بنى جديدة عن طريق التعديل المباشر للإحداثيات ثلاثية الأبعاد لكل ذرة.
تكمن قدرته في «التصميم مع قيود». فإذا حدد الباحثون ليس فقط مواقع الذرات اللازمة للتفاعل، بل أيضاً شروط تكوّن روابط الهيدروجين ونطاق توزع ذرات معينة داخل البروتين، أخرج النظام بنى تستوفي كل القيود. وقارن الفريق RFdiffusion3 بـ 41 موقعاً نشطاً من إنزيمات موجودة، وتفوق في 37 مجموعة على RFdiffusion2، بسرعة توليد تبلغ نحو عشرة أضعاف الجيل السابق. وقد أكمل كلٌ من إنزيم تحلل الباراوكسون والإنزيم الفاصل للببتيدات، المصممان به، التفاعلات المتوقعة بنجاح في تجارب حقيقية. وبانتقاله من «التنبؤ بالبنية» إلى «بناء البنية حسب الوظيفة»، يدفع هذا الذكاء الاصطناعي الذي ينحت ذرةً ذرة هندسة البروتينات نحو دقة غير مسبوقة.