Le 21 octobre, heure de Pékin, la société de biotechnologie PerturbAI a annoncé les derniers développements de sa collaboration avec OpenAI. Les deux parties, avec le Scripps Research Institute, ont développé un cadre de raisonnement IA dans lequel près de 2000 agents IA travaillent en parallèle pour aider les scientifiques à analyser des données d'expériences biologiques complexes, à rechercher dans la littérature et à proposer des hypothèses pouvant être testées par des expériences ultérieures.
Selon PerturbAI, en analysant son atlas génomique du cerveau entier, ce système a accompli l'analyse des données et l'intégration des résultats de recherche en 32 minutes. L'entreprise estime qu'un travail effectué par des humains de manière séquentielle, analyses et revue de littérature comprises, aurait pu prendre de plusieurs mois à un an. Cette comparaison temporelle provient d'estimations de l'entreprise et non d'un test contrôlé simultané avec des équipes humaines.
Dans le processus concret, les agents IA analysent respectivement les réponses cellulaires et cherchent dans la littérature scientifique, relient les résultats expérimentaux aux connaissances biologiques existantes, puis les agrègent en une « carte de raisonnement » reliant gènes, réponses cellulaires, recherches existantes et mécanismes biologiques possibles, offrant aux scientifiques des pistes pour des investigations plus poussées.
L'équipe de recherche a également invité des experts en biologie à évaluer les rapports selon la nouveauté, le niveau de preuve, la priorité des recherches ultérieures et le niveau de confiance. Dans une évaluation en aveugle comparée aux rapports générés par un agent IA unique, les experts ont préféré les explications du système multi-agents dans 75 % des cas. Ce résultat reflète la préférence des experts pour les rapports et ne peut pas être interprété directement comme un taux d'exactitude des conclusions de recherche.
Les données utilisées pour cette analyse proviennent de l'atlas CRISPR du cerveau entier publié par PerturbAI en mars (3e mois) de cette année, couvrant environ 8000000 cellules. L'entreprise indique que cet atlas a été généré en quelques mois et a déjà dépassé les 40000 téléchargements. Par la suite, PerturbAI a également construit des atlas propriétaires couvrant les maladies métaboliques et la recherche sur le vieillissement.
La collaboration entre les deux parties dure depuis environ un an ; elles utiliseront ensuite les données de biologie causale générées par PerturbAI dans des systèmes vivants pour mener conjointement la découverte de nouvelles cibles médicamenteuses. Les résultats ont été publiés via un preprint commun et un blog ; les résultats divulgués à ce jour concernent principalement l'interprétation des données et la génération d'hypothèses de recherche, et les pistes proposées doivent encore être validées par des expériences ultérieures.