IT之家 Mensaje del 15 de octubre: según informó TechCrunch, Colossal Biosciences presentó el miércoles, hora local, una nueva plataforma de inteligencia artificial para ayudar a acelerar la investigación relacionada con la desextinción de especies extintas.
Según IT之家, esta plataforma llamada GenoMorph combina tecnologías avanzadas de morfología tridimensional, genómica comparada y biología del desarrollo en proyectos de resurrección con datos genéticos limitados, en los queFiltrar los genes objetivo que pueden utilizarse para la edición genética。La empresa está utilizando esta plataforma para impulsar el plan de resurrección del dodo, y los datos genómicos disponibles del dodo son sumamente escasos.
A modo de ejemplo, la empresa obtuvo 100 muestras de genoma en el proyecto de resurrección del mamut, pero para el proyecto del dodo solo había un genoma disponible. La empresa señaló que el frío del entorno en el que vivían los mamuts favorece mejor la conservación del ADN, mientras que los dodos habitaban en zonas tropicales, por lo que el ADN de mamut que se ha conservado es mucho más abundante.
El director ejecutivo y cofundador de Colossal Biosciences, Ben Lamm, declaró en una entrevista: "Normalmente, los científicos pueden comparar un gran número de genomas para identificar las diferencias genéticas que determinan un rasgo específico. Pero con el ADN antiguo de especies extintas no contamos con esas condiciones: la cantidad de ADN disponible de estas especies es mínima y solo se puede obtener un pequeño número de genomas completos."
Ramu explicó que, para construir la plataforma GenoMorph, el equipo recopiló una gran cantidad de datos de desarrollo de pollos, codornices, patos y palomas, e integró información genética de más de 70 especies de aves, así como datos de mediciones tridimensionales de cráneos. La plataforma tardó más de un año en desarrollarse y se apoya, además, en los resultados de investigación acumulados por la empresa durante años en el campo de la resurrección de especies extintas.
"Este sistema de IA puede aprender qué segmentos de ADN se encuentran activos durante el desarrollo del pico y de las estructuras faciales de las aves, y utilizar esa información para predecir qué mecanismos de regulación genética dieron forma al aspecto icónico del dodo." Comparó esta plataforma con un "mapa del tesoro del genoma del dodo": el equipo ya no necesita examinar una cantidad masiva de posibles diferencias genéticas, ya que GenoMorph puede filtrar directamente los sitios de variación génica realmente clave.
Añadió: "Hasta ahora hemos identificado aproximadamente 2300 dianas de edición de ADN prometedoras para la modificación de la morfología craneofacial del dodo; el siguiente paso es validarlas en el laboratorio." Ram indicó que GenoMorph ayudará a la empresa a superar uno de los mayores cuellos de botella de la investigación sobre la desextinción: determinar qué cambios génicos exactos dan lugar a los rasgos únicos de las especies extintas. No obstante, los científicos aún deben verificar si estas ediciones pueden producir las características morfológicas deseadas.
«Hemos desarrollado un nuevo sistema que utiliza nanopartículas lipídicas para introducir directamente herramientas de edición genética en embriones de aves en desarrollo». Este enfoque permite al equipo observar cómo cambios en genes específicos afectan el desarrollo de las aves, «sin tener que esperar a que las aves completen todo su ciclo de reproducción hasta la madurez sexual».
La empresa anunció simultáneamente el miércoles que la población actual de palomas de Nicobar ya ha alcanzado las 36, y que se han cultivado con éxito células clave capaces de desarrollarse en óvulos y espermatozoides.
“La paloma de Nicobar es la especie viva más cercana al dodo, y estas células son el componente central de nuestro trabajo para criar individuos con rasgos del dodo.” Dijo que el siguiente paso del equipo es validar en el laboratorio las predicciones generadas por GenoMorph. Ram añadió: “Lo más alentador es que las diversas tecnologías que hemos desarrollado se están integrando gradualmente y también pueden dar apoyo a proyectos de investigación de otros grupos completamente distintos en el árbol de la vida.”
Cuando se le preguntó si este tipo de edición genética es segura, Lam dijo que el propósito de desarrollar tecnologías como GenoMorph es hacer que la ingeniería genética sea "más precisa, controlable y verificable". La plataforma en sí no realiza operaciones de edición genética, solo ayuda a los equipos de investigación a filtrar propuestas de modificaciones genéticas que merezcan un estudio a fondo.
"Encontrar posibles puntos de edición no significa que vayamos a implantarlo de inmediato en animales, ni que se dé por sentado que es seguro", añadió. "Cuanto más precisa sea nuestra identificación y validación de estos cambios genéticos, más fiables serán las decisiones a lo largo de todo el proceso de investigación."
Al mismo tiempo, esta nueva tecnología de Colossal Biosciences ya ha recibido el respaldo de Peter Diamandis, fundador de XPRIZE. Diamandis, inversor de Colossal Biosciences, anunció el miércoles la creación de una nueva firma de capital riesgo, NeoGenesis Capital, dedicada específicamente a apoyar a las empresas que utilicen la plataforma biológica programable de Colossal Biosciences en los ámbitos de la medicina, la agricultura y la conservación de especies.