IT之家 Le 15 octobre, selon un rapport de TechCrunch, Colossal Biosciences a lancé mercredi, heure locale, une toute nouvelle plateforme d'intelligence artificielle destinée à accélérer les recherches sur la résurrection d'espèces éteintes.
Selon IT之家, cette plateforme appelée GenoMorph combine des techniques avancées de morphologie tridimensionnelle, de génomique comparative et de biologie du développement ; dans les projets de résurrection où les données génétiques sont limitées,Sélectionner les gènes cibles pouvant être utilisés pour l'édition génétique。La société utilise cette plateforme pour faire avancer son projet de résurrection du dodo, alors que les données génomiques disponibles sur le dodo sont extrêmement rares.
Par exemple, pour le projet de résurrection du mammouth, la société a obtenu 100 échantillons de génome, alors que pour le projet du dodo, un seul génome était disponible. Selon la société, l'environnement froid dans lequel vivait le mammouth favorise mieux la conservation de l'ADN, tandis que le dodo vivait sous des climats tropicaux, c'est pourquoi l'ADN de mammouth conservé est bien plus abondant.
« Habituellement, les scientifiques peuvent comparer un grand nombre de génomes afin d'identifier les différences génétiques qui déterminent un caractère particulier. Mais pour l'ADN ancien d'espèces éteintes, nous n'avons pas cette possibilité : les réserves d'ADN de ces espèces sont extrêmement limitées et l'on ne peut obtenir qu'un petit nombre de génomes complets », a déclaré Ben Lamm, cofondateur et directeur général de Colossal Biosciences, dans une interview.
Ram explique que pour construire la plateforme GenoMorph, l'équipe a recueilli de nombreuses données de développement provenant de poulets, de cailles, de canards et de pigeons, et a intégré les informations génétiques de plus de 70 espèces d'oiseaux ainsi que des mesures tridimensionnelles de crânes. La plateforme a été développée en plus d'un an, en s'appuyant également sur les résultats de recherche accumulés par l'entreprise depuis de nombreuses années dans le domaine de la résurrection d'espèces éteintes.
« Cette IA peut apprendre quels segments d'ADN sont activés au cours du développement du bec et des structures faciales chez les oiseaux, et utiliser ces informations pour prédire quels mécanismes de régulation génétique ont façonné la silhouette emblématique du dodo. » Il compare cette plateforme à une « carte au trésor du génome du dodo » : l'équipe n'a plus besoin d'examiner d'innombrables différences génétiques potentielles, GenoMorph peut directement identifier les variations génétiques réellement determinantes.
Il a ajouté : « À ce jour, nous avons identifié environ 2300 cibles d'édition d'ADN susceptibles d'être utilisées pour modifier la morphologie cranio-faciale du dodo ; la validation pourra ensuite être menée en laboratoire. » Ramm a indiqué que GenoMorph aidera l'entreprise à surmonter l'un des plus grands obstacles de la recherche sur la dé-extinction : déterminer quelles modifications génétiques précises ont façonné les caractéristiques uniques des espèces éteintes. Toutefois, les scientifiques devront encore vérifier si ces opérations d'édition permettent effectivement d'obtenir les traits morphologiques visés.
« Nous avons développé un nouveau système qui utilise des nanoparticules lipidiques pour acheminer directement les outils d'édition génétique dans des embryons d'oiseaux en cours de développement. » Cette approche permet à l'équipe d'observer comment des modifications de gènes spécifiques affectent le développement des oiseaux, « sans avoir à attendre que les oiseaux achèvent tout leur cycle de reproduction jusqu'à la maturité sexuelle ».
L'entreprise a annoncé simultanément mercredi que la population de colombes de Nicobar atteint désormais 36 individus, et qu'elle a réussi à cultiver les cellules clés capables de se développer en ovules et en spermatozoïdes.
« Le Nicobar est l'espèce vivante la plus proche du dodo, et ces cellules constituent l'élément central de notre effort pour produire des individus présentant des caractéristiques du dodo. » Il a déclaré que la prochaine étape consisterait pour l'équipe à valider en laboratoire les prédictions fournies par GenoMorph. Ramsay a ajouté : « Ce qui est le plus passionnant, c'est que les différentes technologies que nous avons développées convergent progressivement et peuvent également soutenir des projets de recherche portant sur des groupes entièrement différents de l'arbre de l'évolution de la vie. »
Interrogée sur la sécurité de ce type d'édition génétique, Ram a déclaré que le but du développement de technologies comme GenoMorph est de rendre le génie génétique « plus précis, contrôlable et vérifiable ». La plateforme elle-même n'effectue aucune opération d'édition génétique ; elle aide simplement les équipes de recherche à sélectionner les modifications génétiques qui méritent d'être étudiées en profondeur.
« Trouver une cible d'édition potentielle ne signifie pas que nous allons immédiatement l'implanter chez un animal, ni que nous partons du principe qu'elle est sûre. », a-t-il ajouté : « Plus nous identifions et validons précisément ces modifications génétiques, plus les décisions prises tout au long du processus de recherche seront fiables. »
Parallèlement, cette nouvelle technologie de Colossal Biosciences a déjà reçu l'approbation de Peter Diamandis, fondateur du XPRIZE. Diamandis, qui est investisseur de Colossal Biosciences, a annoncé mercredi la création d'une nouvelle société de capital-risque, NeoGenesis Capital, destinée spécifiquement à soutenir les entreprises qui utilisent la plateforme biologique programmable de Colossal Biosciences dans les domaines de la santé, de l'agriculture et de la conservation des espèces.